Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms