Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNRC6CQ9HCJ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms