Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms