Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BARHL1Q9BZE3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms