Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms