Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MXD3Q9BW11 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MXD3Q9BW11 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms