Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRAF4Q9BUZ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF4Q9BUZ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms