Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
MCMBPQ9BTE3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms