Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBP4Q96PP9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms