Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM20AQ96MK3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms