Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN4Q92575 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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