Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC107Q8WV48 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms