Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms