Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC21AQ8NDW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC21AQ8NDW8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
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