Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms