Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00337Q8N6G1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms