Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP1Q86WV1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms