Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PAXIP1Q6ZW49 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAXIP1Q6ZW49 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms