Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSSK4Q6SA08 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSK4Q6SA08 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms