Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms