Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HSP90AA4PQ58FG1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HSP90AA4PQ58FG1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms