Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C4orf46Q504U0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms