Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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