Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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RTN1Q16799 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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