Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA3Q16787 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA3Q16787 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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