Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FXNQ16595 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FXNQ16595 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FXNQ16595 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FXNQ16595 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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