Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNCBQ16143 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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