Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZFHX3Q15911 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZFHX3Q15911 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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