Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNHIT3Q15649 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNHIT3Q15649 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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