Protein–RNA interactions for Protein: Q15513

SPHAR, Protein SPHAR, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHARQ15513 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPHARQ15513 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPHARQ15513 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPHARQ15513 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPHARQ15513 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPHARQ15513 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPHARQ15513 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPHARQ15513 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms