Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IKBKEQ14164 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IKBKEQ14164 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms