Protein–RNA interactions for Protein: Q13561

DCTN2, Dynactin subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN2Q13561 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DCTN2Q13561 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DCTN2Q13561 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms