Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMED1Q13445 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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