Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB2A2Q13296 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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SCGB2A2Q13296 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB2A2Q13296 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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