Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL6Q02878 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms