Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFITM3Q01628 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms