Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HERVK_113P61574 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms