Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAP1L1P55209 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms