Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP12AP54707 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms