Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC4A3P48751 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms