Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDKN1BP46527 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms