Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GGCXP38435 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GGCXP38435 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGCXP38435 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGCXP38435 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGCXP38435 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGCXP38435 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGCXP38435 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGCXP38435 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GGCXP38435 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GGCXP38435 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GGCXP38435 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GGCXP38435 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms