Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP1P32455 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP1P32455 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP1P32455 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP1P32455 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP1P32455 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP1P32455 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP1P32455 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP1P32455 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms