Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRABP1P29762 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms