Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms