Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN2P17655 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN2P17655 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms