Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB4P16144 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB4P16144 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms