Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VEGFAP15692 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VEGFAP15692 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms