Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms