Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSN3P07498 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSN3P07498 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CSN3P07498 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSN3P07498 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSN3P07498 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSN3P07498 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN3P07498 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN3P07498 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN3P07498 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN3P07498 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN3P07498 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN3P07498 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CSN3P07498 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms